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自洽聚类法识别大肠杆菌SD序列
自洽聚类法识别大肠杆菌SD序列
Identification of Shine-Dalgarno Region by the Method of Self-consistent Information Clustering in E.coli
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<<内蒙古大学学报（自然科学版）>>2008年 第39卷 第03期
作者: 王晓花, 李宏,
期刊-核心期刊 ISSN : 1000-1638(2008)03-0314-07
用自洽聚类方法判定大肠杆菌蛋白质编码基因SD序列强弱,给出构成强SD序列的17种碱基关联模式.将全部SD序列按作用强弱不同分为三类:强、中、弱,发现强弱不同时最偏好模式不同,如GGAGG是弱SD序列的最偏好模式,AAGGA是强SD序列的最偏好模式.同一模式距起始密码子的距离不同时,所起的调控作用也不同,如GGAG模式中的A在强SD序列中位于-8位点,在弱SD序列中位于-7和-9位点.平均来说,各SD序列的-9位点上碱基G出现的概率最大.结果还表明SD序列越强,基因的表达水平越高,SD序列越弱,基因表达水平越低.SD序列与anti-SD序列的配对程度和相对位置影响起始密码子的识别和翻译效率.
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可表达和分泌β-半乳糖苷酶的大肠杆菌-乳酸菌穿梭质粒及其构建方法与应用 发明人:汪 川,张朝武,刘衡川,余 倩,许 欣,裴晓方,王国庆,林怡伶,申请人:四川大学,, 发明专利 中华人民共和国国家知识产权局 2007年 |
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